Analysis of changes in transcription start site distribution by a classification approach

نویسندگان
چکیده

برای دانلود رایگان متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

Towards accurate transcription start site prediction: a modelling approach

Promoter prediction in bacteria is a classical bioinformatics problem, where available methods for regulatory element detection exhibit a very high number of false positives. We here argue that accurate transcription start site (TSS) prediction is a complex problem, where available methods for sequence motif discovery are not in itself well adopted for solving the problem. We here instead propo...

متن کامل

a swot analysis of the english program of a bilingual school in iran

با توجه به جایگاه زبان انگلیسی به عنوان زبانی بین المللی و با در نظر گرفتن این واقعیت که دولت ها و مسئولان آموزش و پرورش در سراسر جهان در حال حاضر احساس نیاز به ایجاد موقعیتی برای کودکان جهت یاد گیری زبان انگلیسی درسنین پایین در مدارس دو زبانه می کنند، تحقیق حاضر با استفاده از مدل swot (قوت ها، ضعف ها، فرصتها و تهدیدها) سعی در ارزیابی مدرسه ای دو زبانه در ایران را دارد. جهت انجام این تحقیق در م...

15 صفحه اول

Transcription Start Site Evolution in Drosophila

Transcription start site (TSS) evolution remains largely undescribed in Drosophila, likely due to limited annotations in non-melanogaster species. In this study, we introduce a concise new method that selectively sequences from the 5'-end of mRNA and used it to identify TSS in four Drosophila species, including Drosophila melanogaster, D. simulans, D. sechellia, and D. pseudoobscura. For verifi...

متن کامل

Transcription start site associated RNAs in bacteria

Here, we report the genome-wide identification of small RNAs associated with transcription start sites (TSSs), termed tssRNAs, in Mycoplasma pneumoniae. tssRNAs were also found to be present in a different bacterial phyla, Escherichia coli. Similar to the recently identified promoter-associated tiny RNAs (tiRNAs) in eukaryotes, tssRNAs are associated with active promoters. Evidence suggests tha...

متن کامل

Systematic Clustering of Transcription Start Site Landscapes

Genome-wide, high-throughput methods for transcription start site (TSS) detection have shown that most promoters have an array of neighboring TSSs where some are used more than others, forming a distribution of initiation propensities. TSS distributions (TSSDs) vary widely between promoters and earlier studies have shown that the TSSDs have biological implications in both regulation and functio...

متن کامل

ذخیره در منابع من


  با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ژورنال

عنوان ژورنال: Gene

سال: 2014

ISSN: 0378-1119

DOI: 10.1016/j.gene.2013.12.038